RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMD4Q96H15 378 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DMBP28068 263 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PSG9Q00887 426 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF3BA8MYP8 253 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB125Q8N687 156 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR25Q96S07 402 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 SMKR1H3BMG3 65 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TCTAP57738 103 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ORMDL3Q8N138 153 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 VGLL1Q99990 258 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 COX8AP10176 69 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PRTN3P24158 256 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 NRGNQ92686 78 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR183P32249 361 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.084e-7■■■■□ 25.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TWIST1Q15672 202 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R1W7 72 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 U3KQK5 164 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOGP84095 191 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 THYN1Q9P016 225 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 TENM4Q6N022 2769 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSGP08311 255 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 A1L4Q6 167 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CKS2P33552 79 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 RABAC1Q9UI14 185 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNG7P62955 275 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 NPYP01303 97 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHG4P01861 327 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 PCP4P48539 62 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EP13 123 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM11P17152 192 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 RBX1P62877 108 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ORM1P02763 201 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 CD5LO43866 347 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 HBDP02042 147 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 BMI1P35226 326 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC8Q13216 396 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N6K4 173 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF6P10767 208 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 DTX2Q86UW9 622 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF575Q86XF7 245 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLC6P0CF74 106 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 SCGB2A1O75556 95 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAC2D3DTV9 90 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 PAX8Q06710 450 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 ECSCRQ19T08 205 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF182Q8N6D2 247 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS8-AS1O95177 125 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf71A4D174 169 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf32Q32M92 178 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 C18orf15Q96N68 181 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N9W7 124 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF151Q2KHN1 245 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 EBI3Q14213 229 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms