RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 SLAQ13239 276 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR20EP86478 221 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR20CP86479 221 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR20DP86480 221 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR20BP86481 221 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR20AP86496 221 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5PR19 223 aa13.71□□□□□ -0.21
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SH3BP4-202ENST00000392011 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00158P58513 81 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR25Q96S07 402 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM231BA6NCW3 169 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.7□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 GATA3P23771 443 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM95Q3KNT9 176 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 INSP01308 110 aa13.7□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 CT83Q5H943 113 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 XCL2Q9UBD3 114 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FXYD5Q96DB9 178 aa13.69□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 A8MWP6 167 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BRN7 92 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM120AOSQ5T036 256 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM238C9JI98 176 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB130AP0DP74 79 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS46E5RG02 174 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf52Q96A22 123 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE13Q4V321 117 aa13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP4-202ENST00000392011 CR1LQ2VPA4 569 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP8Q8NA92 274 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf77Q96MU5 243 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R2P5 195 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 Q96MF0 132 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SPXQ9BT56 116 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 WISP2O76076 250 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 A8MWV9 139 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 EREGO14944 169 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF2RP11717 2491 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZSR3 168 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM86BQ8N661 226 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 VGLL1Q99990 258 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TCF15Q12870 199 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LHBP01229 141 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZWC4 215 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 KIR3DS1Q14943 382 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV2-70P01814 119 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFA4O00483 81 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CKS1BP61024 79 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF124Q15973 351 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-DMBP28068 263 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PAX4O43316 350 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.63□□□□□ -0.23
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