RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.37□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.37□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 LINC00479Q96M42 142 aa11.37□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF492Q9P255 531 aa11.37□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 H3BRN7 92 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TCRAP04437 139 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 CLEC3BP05452 202 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 PKIAP61925 76 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 NUDT11Q96G61 164 aa11.36□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 GZMBP10144 247 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ARL3P36405 182 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 SYNJ2BPP57105 145 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 GNG5P63218 68 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 CT83Q5H943 113 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 MLST8Q9BVC4 326 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 WIPF1O43516 503 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 GNG7O60262 68 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 LTAP01374 205 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 S100A7P31151 101 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 GPR183P32249 361 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 DEFA6Q01524 100 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TSKUQ8WUA8 353 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 RNF125Q96EQ8 232 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TXN2Q99757 166 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.35□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TSTD3H0UI37 97 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 ATP6V0BQ99437 205 aa11.34□□□□□ -0.59
PXDC1-201ENST00000380277 OR2T8A6NH00 312 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 F8W735 103 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 SAP30O75446 220 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 INSL3P51460 131 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 TCL1AP56279 114 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 IQCJQ1A5X6 159 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 LEMD1Q68G75 181 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 BAGE3Q86Y29 109 aa11.33□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 A8MWL6 223 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 K7EQM0 130 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 IGLC2P0DOY2 106 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 KRTAP10-11P60412 298 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 Q56UQ5 140 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 GPHB5Q86YW7 130 aa11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 FAM231BA6NCW3 169 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 APCSP02743 223 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 IL4P05112 153 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 RAB4BP61018 213 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 PDE6HQ13956 83 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 Q86TA4 180 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 PEMTQ9UBM1 199 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.31□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 P01737 135 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 PRR27Q6MZM9 219 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 REC114Q7Z4M0 266 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 NUP35Q8NFH5 326 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 LGALS9O00182 355 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 NUPR1O60356 82 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 SPINK4O60575 86 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 SERF1AO75920 110 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 CSN3P07498 182 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 CTSGP08311 255 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.3□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.29□□□□□ -0.6
PXDC1-201ENST00000380277 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms