RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 TM4SF20Q53R12 229 aa9.93□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCF24Q7RTU0 167 aa9.93□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.93□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.93□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GW15 77 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM6P0DI80 62 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRISP2P16562 243 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 RIGQ13278 110 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8TAT8 98 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ASCL2Q99929 193 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.92□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 CREBBPQ92793 2442 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A087WW49 117 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRAC2D3DTV9 90 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERCC8Q13216 396 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.91□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 APCP25054 2843 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GXF2 115 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 SOCS3O14543 225 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAMPP49913 170 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRIP1P50238 77 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZSV7 163 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 GTSF1Q8WW33 167 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPF1Q92782 380 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00477Q96M19 166 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.9□□□□□ -0.82
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GUT8 65 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM213A2RRL7 107 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01619G3V211 115 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 HAX1O00165 279 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRD5A1P18405 259 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q0VG73 95 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM18Q96B42 140 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 JMJD8Q96S16 334 aa9.89□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 GZMBP10144 247 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 FABP4P15090 132 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYNJ2BPP57105 145 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 BAGE3Q86Y29 109 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 C20orf173Q96LM9 149 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf57Q99622 126 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 PEMTQ9UBM1 199 aa9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.87□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ORM1P02763 201 aa9.87□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRIP30626 198 aa9.87□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.87□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ITPR2Q14571 2701 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 C2orf70A6NJV1 201 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 IFITM10A6NMD0 228 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAFAH1B2P68402 229 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01559Q495D7 138 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPPP3Q9BW30 176 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 C16orf95Q9H693 158 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ESM1Q9NQ30 184 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 CENPEQ02224 2701 aa9.86□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 ITPR3Q14573 2671 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTRLP40313 264 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLAQ13239 276 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 GATD1Q8NB37 220 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.85□□□□□ -0.83
NME1-NME2-201ENST00000376392 AMBPP02760 352 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms