RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KHDC3LQ587J8 217 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NCMAPQ5T1S8 102 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX261Q6UWH6 196 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZQT0 140 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MMGT1Q8N4V1 131 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5D14Q8NGL3 314 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5H6Q8NGV6 325 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10AC1Q8NH08 325 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PRELID3AQ96N28 172 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GINS4Q9BRT9 223 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NPCDR1Q9BY65 106 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MYH8P13535 1937 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PLXNA2O75051 1894 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ANK1P16157 1881 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD1O14646 1710 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 COL24A1Q17RW2 1714 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SHROOM2Q13796 1616 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2T8A6NH00 312 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MWV9 139 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 FNDC10F2Z333 226 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BMG7 143 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BRN7 92 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RER1O15258 196 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAPC5O75971 98 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TRGC1P0CF51 173 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAIN1P0CW23 69 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GNG4P50150 75 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PKIAP61925 76 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KLRD1Q13241 179 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 DPPA3Q6W0C5 159 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF826PQ6ZT77 177 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00311Q8N616 119 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PP6455Q8WZ26 134 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 AQP3Q92482 292 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 DIRC1Q969H9 104 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4C12Q96R67 309 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00467Q9BRT7 94 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM191AQ9H0A3 160 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB11Q9NX14 153 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 COMMD3Q9UBI1 195 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SCN3AQ9NY46 2000 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NAIPQ13075 1403 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JMM0 328 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPB8 328 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 BBIP1A8MTZ0 92 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR3DP1A8MWS1 328 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R143 59 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 UQCRQO14949 82 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM17BO60830 172 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNA17P01571 189 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 HBDP02042 147 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CD2P06729 351 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYGAP11844 174 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DRB4P13762 266 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK6Q00534 326 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MYL5Q02045 173 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM155Q4W5P6 130 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MEIG1Q5JSS6 88 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CLLU1Q5K131 121 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 IZUMO2Q6UXV1 221 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM91Q6ZNR0 172 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 AAED1Q7RTV5 226 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5D16Q8NGK9 328 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF714Q96N38 554 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RETNLBQ9BQ08 111 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL2L10Q9HD36 194 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 FKBP11Q9NYL4 201 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC4Q99102 2169 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TET3O43151 1660 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRFP10586 1907 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MED14O60244 1454 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRL2O95490 1459 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MGAMO43451 1857 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF20BQ96Q89 1820 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CASZ1Q86V15 1759 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NUMA1Q14980 2115 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MON2Q7Z3U7 1717 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms