RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 LYPD6Q86Y78 171 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 D6R8Y8 96 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 PEMTQ9UBM1 199 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 RNF182Q8N6D2 247 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 CT83Q5H943 113 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 F2Z2F3 143 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF134P52741 427 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF138P52744 262 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 SAA4P35542 130 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 OVOL1O14753 267 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PRX2 142 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LAGE3Q14657 143 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 AMTNQ6UX39 209 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 Q6ZSR3 168 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LINC00479Q96M42 142 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 SRD5A1P18405 259 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LYPD1Q8N2G4 141 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 LINC01587Q99440 93 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 CEND1Q8N111 149 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 GGTLC3B5MD39 225 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRK-204ENST00000368210 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NBL1P41271 181 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF726P1Q15940 193 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 OBSL1O75147 1896 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 IGFL2Q6UWQ7 119 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 LINC00311Q8N616 119 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 CNTFRP26992 372 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF329Q86UD4 541 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 Q8TAT8 98 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 PCDH15Q96QU1 1955 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 SLC25A20O43772 301 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RCHY1Q96PM5 261 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFC2O95298 119 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 PRR31Q5SQ13 230 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NDPQ00604 133 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RNF183Q96D59 192 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NOTCH2Q04721 2471 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 PRSS33Q8NF86 280 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 V9GYV3 84 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 RBMY1CP0DJD4 496 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 WT1-ASQ06250 92 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 UBE2E1P51965 193 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 C12orf74Q32Q52 190 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 UTF1Q5T230 341 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 SPRY4Q9C004 299 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 K7ERJ3 54 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 MRAPQ8TCY5 172 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 K7EM74 188 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NUPR1O60356 82 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 USMG5Q96IX5 58 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 DKK4Q9UBT3 224 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 SH2D1AO60880 128 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 NCR2O95944 276 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 Q86TA4 180 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-204ENST00000368210 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.2 ms