RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ORM2P19652 201 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CRYGSP22914 178 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ACP1P24666 158 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MFAP2P55001 183 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 HBBP68871 147 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 EBI3Q14213 229 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF77Q15935 545 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 UTF1Q5T230 341 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf128Q5T292 105 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MOB3BQ86TA1 216 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PCP2Q8IVA1 136 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 OR10J6PQ8NGY7 276 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RAB37Q96AX2 223 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM101Q96IK0 257 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 BMFQ96LC9 184 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF488Q96MN9 340 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ODF3Q96PU9 254 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MGST2Q99735 147 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IMUPQ9GZP8 106 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM167BQ9NRX6 74 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CACNA1DQ01668 2161 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 OOEPA6NGQ2 149 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 F5H768 121 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ORM1P02763 201 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 STATHP02808 62 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SCTP09683 121 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CD27P26842 260 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DMBP28068 263 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CSN1S1P47710 185 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf61Q13536 156 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FXYD3Q14802 87 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00596Q86U02 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FADS6Q8N9I5 356 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 NABP1Q96AH0 204 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DL4Q99706 377 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FBXL15Q9H469 300 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DEPPQ9NTK1 212 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DSCAMO60469 2012 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PR77 199 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FRG2CA6NGY1 282 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HIGD1CA8MV81 97 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C9JAW5 83 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 K7ERJ3 54 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 UQCRQO14949 82 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 NPFFO15130 113 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFA7O95182 113 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FSTL3O95633 263 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LTAP01374 205 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV3-11P04433 115 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5G1P05496 136 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CD7P09564 240 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00694P0DN24 101 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CRYGAP11844 174 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CCL11P51671 97 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 MFAP4P55083 255 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FGF12P61328 243 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EDDM3AQ14507 147 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CST6Q15828 149 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D28Q2M2D7 210 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PIGYQ3MUY2 71 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DEFB134Q4QY38 66 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 Q5XG85 94 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DRAM1Q8N682 238 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OR1L4Q8NGR5 311 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms