RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
HPS1-204ENST00000361490 C5orf52A6NGY3 159 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGLC2P0DOY2 106 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SLURP1P55000 103 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 M0R381 172 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ZNF138P52744 262 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TSKUQ8WUA8 353 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.95□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SH2D1AO60880 128 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGLV2-8P01709 118 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PAFAH1B2P68402 229 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SERF1AO75920 110 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FOLR2P14207 255 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 BMI1P35226 326 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TCTAP57738 103 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 HBBP68871 147 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PMCHL1Q16048 86 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.94□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 F2Z2F3 143 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 S100A8P05109 93 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 HOXA5P20719 270 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ID1P41134 155 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 RIGQ13278 110 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 A0A087WW49 117 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 A0A1B0GUT8 65 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 HLA-DQA1P01909 254 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 NRN1Q9NPD7 142 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 F5H697 171 aa8.93□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PRR25Q96S07 402 aa8.93□□□□□ -0.98
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HPS1-204ENST00000361490 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 NDUFA4O00483 81 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGF1P05019 195 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SLAQ13239 276 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 Q6YL49 198 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TMEM213A2RRL7 107 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 MGPP08493 103 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 PDE6HQ13956 83 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.92□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LINC00587B1AMM8 73 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LTAP01374 205 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 H3BVH4 76 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 M0R2Z0 102 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 NCR2O95944 276 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FOXE3Q13461 319 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 ATOH7Q8N100 152 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.91□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.91□□□□□ -0.98
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HPS1-204ENST00000361490 RAB4AP20338 218 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 MT-ND6P03923 174 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 CKS2P33552 79 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 Q6ZQT7 251 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 FA2HQ7L5A8 372 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.9□□□□□ -0.98
HPS1-204ENST00000361490 UBE2CO00762 179 aa8.9□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 GTSF1Q8WW33 167 aa8.9□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 NUPR1O60356 82 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 KIR3DS1Q14943 382 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 SMPXQ9UHP9 88 aa8.89□□□□□ -0.99
HPS1-204ENST00000361490 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.89□□□□□ -0.99
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