RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A20O43772 301 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 MORN5Q5VZ52 161 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD177Q8N6Q3 437 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TECTAO75443 2155 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 D6R8Y8 96 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS46E5RG02 174 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PYYP10082 97 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF134P52741 427 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N1Y9 231 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 KALRNO60229 2985 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-48P01763 117 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRYGBP07316 175 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2D3P61077 147 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2D2P62837 147 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR20EP86478 221 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR20CP86479 221 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR20DP86480 221 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR20BP86481 221 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR20AP86496 221 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF56Q15929 161 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 MLANAQ16655 118 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIFOQ8TCI5 191 aa8.53□□□□□ -1.04
APOBEC3C-201ENST00000361441 HLA-DRB4P13762 266 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV9Q99603 122 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R2P5 195 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP5LO75964 103 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.52□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TACC2O95359 2948 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PRX2 142 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 HAX1O00165 279 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8IYB0 196 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 GFRA3O60609 400 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPYP01303 97 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ORM1P02763 201 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PMVKQ15126 192 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF329Q86UD4 541 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXC2Q99958 501 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.51□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCE1Q9P212 2302 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 RS1O15537 224 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf88P0DMB2 117 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 RITA1Q96K30 269 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GUT8 65 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFNA4P52798 201 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDPNQ86YL7 162 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPIPB3Q92617 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 UQCRQO14949 82 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPINT2O43291 252 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 MSMPQ1L6U9 139 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA1O95477 2261 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLEQ07864 2286 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM23O14925 209 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLXNB1O43157 2135 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDX2P32119 198 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIRPDQ9H106 197 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZMAT4Q9H898 229 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRNDQ9UKY0 176 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.49□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPM2O94777 84 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 OXTP01178 125 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.48□□□□□ -1.05
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMKR1H3BMG3 65 aa8.48□□□□□ -1.05
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