RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278544.9

ACER3-201, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 3,500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-201ENST00000278544 KNCNA6PVL3 124 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 MT-ND4LP03901 98 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 Q86TA4 180 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NAGKQ9UJ70 344 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 RNF24Q9Y225 148 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NDUFA7O95182 113 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 HTN1P15515 57 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 S100A7P31151 101 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PSG3Q16557 428 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 GPR82Q96P67 336 aa10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 K7EQM0 130 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 CSN3P07498 182 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 CXCL1P09341 107 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 DEFB131AP59861 70 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 TMEM183BQ1AE95 376 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PDE6HQ13956 83 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PEMTQ9UBM1 199 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 GCGP01275 180 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 RHEBQ15382 184 aa10□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ATP6V0BQ99437 205 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 K7EMT4 169 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 DCANP1Q8TF63 244 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NUDT11Q96G61 164 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.99□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 M0R2Z0 102 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 FOXL1Q12952 345 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 FMC1Q96HJ9 113 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 REC114Q7Z4M0 266 aa9.98□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 A8MWP6 167 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ORM1P02763 201 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PRM2P04554 102 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 C3orf56Q8N813 242 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 CRIP1P50238 77 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 TAS2R60P59551 318 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PAFAH1B2P68402 229 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PRR25Q96S07 402 aa9.97□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 C9JCJ5 164 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 LGALS9O00182 355 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 LTAP01374 205 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 CT45A10P0DMU9 189 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 NACAE9PAV3 2078 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 A0A087X0K7 114 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 SOCS3O14543 225 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 CD7P09564 240 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 ELOBQ15370 118 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 PRR9Q5T870 116 aa9.96□□□□□ -0.81
ACER3-201ENST00000278544 P01737 135 aa9.96□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 RAB4BP61018 213 aa9.96□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.96□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 ID1P41134 155 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 FHL3Q13643 280 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 COLCA2A8K830 154 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 BMI1P35226 326 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 CAMPP49913 170 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 V9GYV3 84 aa9.95□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 K7EQG2 157 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 GPX1P07203 203 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 FRZBQ92765 325 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 SH2D1AO60880 128 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 MLST8Q9BVC4 326 aa9.94□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 S100PP25815 95 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 ZNF138P52744 262 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 IMMP2LQ96T52 175 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 MEOX2P50222 304 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 FAM210BQ96KR6 192 aa9.93□□□□□ -0.82
ACER3-201ENST00000278544 B4DEV8 164 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms