RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 NCR2O95944 276 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 OR5AL1P0C617 328 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A096LNJ9 63 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 ORM1P02763 201 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 TWIST1Q15672 202 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.82□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PIEZO1Q92508 2521 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1B0GW15 77 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 GAS8-AS1O95177 125 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 GOSR1O95249 250 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 Q6ZQT7 251 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PIFOQ8TCI5 191 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 FA2HQ7L5A8 372 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.81□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 DLEU1O43261 78 aa14.8□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.8□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PRELID3AQ96N28 172 aa14.8□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF747Q9BV97 191 aa14.8□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.79□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.79□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 IGLC6P0CF74 106 aa14.79□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 KLK9Q2XQG4 91 aa14.79□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.79□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 U3KQK5 164 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 BMI1P35226 326 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 PAX8Q06710 450 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF124Q15973 351 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 ORMDL3Q8N138 153 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.78□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 C20orf202A1L168 122 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 NPYP01303 97 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 TRBV12-3P01733 135 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A087X0K7 114 aa14.77□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 LY6EQ16553 131 aa14.77□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 PET117Q6UWS5 81 aa14.77□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 FOXE3Q13461 319 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SFTPCP11686 197 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 CKS2P33552 79 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP5G2Q06055 141 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 LINC01545Q5VT33 79 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.76□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV1-69P01742 117 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 METTL26Q96S19 204 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 RNF185Q96GF1 192 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 ST20Q9HBF5 79 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.75□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 29.4
LPCAT3-201ENST00000261407 TRGV3P03979 118 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 TCTAP57738 103 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 Q6ZS46 218 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SNAI2O43623 268 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 RAB9AP51151 201 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 DEFB1P60022 68 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 MPV17L2Q567V2 206 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.73□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGF1P05019 195 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 S100A7P31151 101 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 CCL19Q99731 98 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 U3KQE9 123 aa14.72□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.71□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.71□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 IGHV3-11P01762 117 aa14.71□□□□□ -0.05
LPCAT3-201ENST00000261407 EVI2AP22794 236 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms