RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 ODF3BA8MYP8 253 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV1-69P01742 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 SGK494Q96LW2 274 aa8.42□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 LY6LH3BQJ8 138 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFA3O95167 84 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 TYMSP04818 313 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGLC1P0CG04 106 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 RRN3P1Q2M238 152 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 SIRPDQ9H106 197 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 CHD6Q8TD26 2715 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 TEX22C9J3V5 150 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 F5H697 171 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 H3BVH4 76 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 SCGB1A1P11684 91 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 GATA3P23771 443 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 PSMB11A5LHX3 300 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 FCN3O75636 299 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 HLA-DQA1P01909 254 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 MFAP2P55001 183 aa8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 CRYGBP07316 175 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 GNG5P63218 68 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 CRYGCP07315 174 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 NPPCP23582 126 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 CAMPP49913 170 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 C15orf32Q32M92 178 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 MPV17L2Q567V2 206 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 GGTLC3B5MD39 225 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 LMO4P61968 165 aa8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 AMY1AP04745 511 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.4□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TM4SF20Q53R12 229 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 I3L2K1 104 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 APCSP02743 223 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 C5orf47Q569G3 176 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 CFHR4Q92496 578 aa8.39□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0G2JLM5 398 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PS18 150 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM189A5PLL7 270 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V0E1O15342 81 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFB8O95169 186 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TCRAP04437 139 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TSPOP30536 169 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE2BQ13066 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 RIGQ13278 110 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE2EQ4V326 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 FXYD5Q96DB9 178 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 CBLN1P23435 193 aa8.38□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 PATE2Q6UY27 113 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 K7EIM0 57 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 NRN1Q9NPD7 142 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 GCSHP23434 173 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 PLXNB1O43157 2135 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.37□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.36□□□□□ -1.07
PRRX1-201ENST00000239461 SMR3AQ99954 134 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms