RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	LY6L	H3BQJ8	138 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNG7	P62955	275 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	KLRD1	Q13241	179 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	FGF6	P10767	208 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	HES1	Q14469	280 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	NBAS	A2RRP1	2371 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC01560	Q8TB33	94 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1B0GW15	77 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	NBR2	O15453	112 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	ORMDL3	Q8N138	153 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743		Q6AWC8	147 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	NPY	P01303	97 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	GAGE12B	A1L429	117 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743		B9A039	149 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743		F8W735	103 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	GAS8-AS1	O95177	125 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	VGLL1	Q99990	258 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	THYN1	Q9P016	225 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNHG16-205	ENST00000587743	CD3E	P07766	207 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NDP	Q00604	133 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	TWIST1	Q15672	202 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	VPS25	Q9BRG1	176 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	CFHR4	Q92496	578 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743		U3KQK5	164 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SPTA1	P02549	2419 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	CKS2	P33552	79 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PRR25	Q96S07	402 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PCP2	Q8IVA1	136 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	RNF5	Q99942	180 aa		12.38	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	JMJD8	Q96S16	334 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	DPM3	Q9P2X0	92 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	HBD	P02042	147 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NMU	P48645	174 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PAX8	Q06710	450 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	MFAP4	P55083	255 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PDE6H	Q13956	83 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB37	Q96AX2	223 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743		H3BUT2	72 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	TM4SF20	Q53R12	229 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	GAGE10	A6NGK3	116 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SAP30	O75446	220 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHG4	P01861	327 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	PPBP	P02775	128 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SEC11A	P67812	179 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFS7	O75251	213 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFA3	O95167	84 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ORM1	P02763	201 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	EVI2A	P22794	236 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ERCC8	Q13216	396 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	NPB	Q8NG41	125 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-205	ENST00000587743	ARPC1A	Q92747	370 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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