RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557915.1

TINF2-204, Transcript of TERF1 interacting nuclear factor 2, human

TSL 2

Gene TINF2, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TINF2-204	ENST00000557915	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915		Q9H3A6	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TINF2-204	ENST00000557915	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SSNA1	O43805	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ADAP1	O75689	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	IL5	P05113	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TAS2R60	P59551	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	HAMP	P81172	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	IFITM2	Q01629	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		Q6ZTI0	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	GPR82	Q96P67	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		A0A087X0K7	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SSSCA1	O60232	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	HYPM	O75409	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	MED6	O75586	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	IFNA7	P01567	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	M6PR	P20645	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	BTC	P35070	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	CDKN1B	P46527	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	XG	P55808	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	RAP2B	P61225	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	B2M	P61769	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SRPX	P78539	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		A0A096LPF7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		H7BYZ3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	NDUFB6	O95139	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SFT2D2	O95562	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SLC25A6	P12236	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	PLP1	P60201	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		Q5VSD8	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		Q6ZQT7	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915		H3BQ15	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	RLN2	P04090	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	RAB14	P61106	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	OPCML	Q14982	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TINF2-204	ENST00000557915	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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