RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 H3BUT2 72 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE13Q4V321 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JRQ6 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 WISP1O95388 367 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 AZU1P20160 251 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 NDPQ00604 133 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HERVK_113P63121 156 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PAX9P55771 341 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 AMN1Q8IY45 258 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PRR25Q96S07 402 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PAX4O43316 350 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1CQ13936 2221 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZRM9 215 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 CXCL1P09341 107 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 MED14OSP0DP75 135 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 K7EMT4 169 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGLC1P0CG04 106 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TCF15Q12870 199 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-39P01824 125 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 VOPP1Q96AW1 172 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRB-208ENST00000550358 WDR81Q562E7 1941 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SIVA1O15304 175 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 CD5LO43866 347 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LTBP2Q14767 1821 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 LTAP01374 205 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SPANXCQ9NY87 97 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ESDP10768 282 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 Q8TAT8 98 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf74Q96GX8 76 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRB-208ENST00000550358 PRR20DP86480 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 PRR20BP86481 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 PRR20AP86496 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IL15RAQ13261 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 NCR2O95944 276 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 MYCNOSP40205 109 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 VWC2LB2RUY7 222 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 A8MWP6 167 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IL17DQ8TAD2 202 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SPRY4Q9C004 299 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 INSL3P51460 131 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 HERV-K104P63124 156 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 GUSBP1Q15486 140 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf159Q96HA4 380 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 CITED1Q99966 193 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C22orf46C9J442 243 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf79P0CE67 100 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 UTF1Q5T230 341 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 FXYD5Q96DB9 178 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-39P01597 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1D-39P04432 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 WT1-ASQ06250 92 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 SIGMAR1Q99720 223 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 F5H768 121 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DRB4P13762 266 aa6.73□□□□□ -1.33
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