RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 TFF2Q03403 129 aa6.97□□□□□ -1.29
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ATXN3-216ENST00000545170 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
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ATXN3-216ENST00000545170 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.92□□□□□ -1.3
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ATXN3-216ENST00000545170 LTAP01374 205 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 LINC01560Q8TB33 94 aa6.92□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 MCM3APO60318 1980 aa6.91□□□□□ -1.3
ATXN3-216ENST00000545170 C17orf100A8MU93 164 aa6.91□□□□□ -1.3
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