RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 SMCO1Q147U7 214 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 TEPPQ6URK8 271 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 LCN15Q6UWW0 184 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 S100A7AQ86SG5 101 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 ODF3Q96PU9 254 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 C7orf71A4D174 169 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 C9JCJ5 164 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-30P01768 117 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-33P01772 117 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 CD3DP04234 171 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 PPT1P50897 306 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 AKR1C1Q04828 323 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 RNF24Q9Y225 148 aa6.66□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 CCNKO75909 580 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 IL5P05113 134 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 SFTA3P0C7M3 94 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 AKR1C4P17516 323 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 TIRAPP58753 221 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 LAGE3Q14657 143 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF479Q96JC4 524 aa6.65□□□□□ -1.34
KDM5A-211ENST00000544777 RGS13O14921 159 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 MPDU1O75352 247 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 IAPPP10997 89 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TBPP20226 339 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 GABARAPL2P60520 117 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF846Q147U1 533 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 Q8N976 141 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 BAALCQ8WXS3 180 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 CNBD2Q96M20 576 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PAXXQ9BUH6 204 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.64□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00869P0C866 280 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PLP1P60201 277 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 BTN1A1Q13410 526 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.63□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0B4J2A0 478 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PRSS46E5RG02 174 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 APOA1P02647 267 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 CD300CQ08708 224 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ARL6Q9H0F7 186 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PRR13Q9NZ81 148 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 COX11Q9Y6N1 276 aa6.62□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SMCO3A2RU48 225 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RNF222A6NCQ9 220 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 KLLNB2CW77 178 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 H3BTX0 84 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SLC17A3O00476 420 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 RAB3DO95716 219 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 GPX1P07203 203 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TGFBR1P36897 503 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SELENOTP62341 195 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OPCMLQ14982 345 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ARV1Q9H2C2 271 aa6.61□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 MED6O75586 246 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 OR4E1P0C645 316 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TAS2R19P59542 299 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 ERCC8Q13216 396 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 C4orf46Q504U0 113 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 TOR2AQ5JU69 321 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 LELP1Q5T871 98 aa6.6□□□□□ -1.35
KDM5A-211ENST00000544777 PATE2Q6UY27 113 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms