RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC4Q99102 2169 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf51A6NDU8 294 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 F5H768 121 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 H7BYZ3 331 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFB4O95168 129 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 SULT1A1P50225 295 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 BCAP31P51572 246 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF846Q147U1 533 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C16orf74Q96GX8 76 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF253O75346 499 aa8.23□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 MED14OSP0DP75 135 aa8.23□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A11P31949 105 aa8.23□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5G3P48201 142 aa8.23□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.22□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.22□□□□□ -1.09
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R3E3 92 aa8.22□□□□□ -1.09
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CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.21□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.21□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.19□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.19□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.18□□□□□ -1.1
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CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE12FP0CL80 117 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE12GP0CL81 117 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE12IP0CL82 117 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 LEPP41159 167 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL18P55774 89 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 HBG1P69891 147 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 HBG2P69892 147 aa8.18□□□□□ -1.1
CLSTN3-211ENST00000541667 ESRGQ1W209 222 aa8.18□□□□□ -1.1
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