RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00869P0C866 280 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 SELENOTP62341 195 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 HOXA5P20719 270 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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PTPRU-210ENST00000527027 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.07□□□□□ -0.64
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PTPRU-210ENST00000527027 XGP55808 180 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 H2BFSP57053 126 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 C18orf15Q96N68 181 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 E5RGE8 158 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRU-210ENST00000527027 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.03□□□□□ -0.64
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