RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 FAM25EA8MYX2 175 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 C16orf90A8MZG2 172 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CST7O76096 145 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 CT45A10P0DMU9 189 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 MIC13Q5XKP0 118 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZRG5 221 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HERC3-211ENST00000513325 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GAGE12BA1L429 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G10O15496 165 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GAGE7O76087 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GAGE12FP0CL80 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GAGE12GP0CL81 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GAGE12IP0CL82 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 CAV2P51636 162 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 RAB31Q13636 194 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 Q9H8V8 135 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 A0A0J9YY99 117 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 SNURFLB1AK76 121 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 RLN2P04090 185 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 M6PRP20645 277 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 HOXA5P20719 270 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 RYR1P21817 5038 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 C5orf51A6NDU8 294 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 LYRM1O43325 122 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 LEPP41159 167 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 GUK1Q16774 197 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ODF3Q96PU9 254 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.75□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TCRBP04435 133 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF503Q96F45 646 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 PFDN5Q99471 154 aa11.74□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 M0R3E3 92 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 BAXQ07812 192 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ESRGQ1W209 222 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 VWC2Q2TAL6 325 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZTI0 123 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 C2orf50Q96LR7 162 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 NUDT15Q9NV35 164 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF253O75346 499 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 CDK2AP2O75956 126 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 SULT1A1P50225 295 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.72□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 IGSF23A1L1A6 192 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 H3BNG1 76 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 S100A11P31949 105 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 S100A10P60903 97 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 ERCC8Q13216 396 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TTC32Q5I0X7 151 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 UPK3BQ9BT76 320 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 HSPG2P98160 4391 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-211ENST00000513325 C7orf71A4D174 169 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB4O95168 129 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 FGF7P21781 194 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 IL15RAQ13261 267 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 RAB32Q13637 225 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 Q9H3A6 140 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.7□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 PYYP10082 97 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 HBG1P69891 147 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 HBG2P69892 147 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 CD300CQ08708 224 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 STX12Q86Y82 276 aa11.69□□□□□ -0.54
HERC3-211ENST00000513325 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.69□□□□□ -0.54
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