RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.36□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.36□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 Q9H3A6 140 aa11.36□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.36□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1W2PPQ1 181 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 AGPAT2O15120 278 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 TSC22D2O75157 780 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 TAS2R30P59541 319 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 KIR3DS1Q14943 382 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 UPK3BQ9BT76 320 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.35□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 PRAC2D3DTV9 90 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 H3BNG1 76 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 H3BTX0 84 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 J3KRW8 73 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 OR4E1P0C645 316 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 HOXA5P20719 270 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 ESRGQ1W209 222 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 C4orf46Q504U0 113 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GGACTQ9BVM4 153 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.34□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 LEPP41159 167 aa11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 HSPG2P98160 4391 aa11.33□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 SLC17A3O00476 420 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 RAB31Q13636 194 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 OPCMLQ14982 345 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZRG5 221 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.32□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TCRBP04435 133 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 CT45A10P0DMU9 189 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 IGLC2P0DOY2 106 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 DEFA1P59665 94 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 DEFA3P59666 94 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP10-2P60368 255 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ARL16Q0P5N6 197 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 GUK1Q16774 197 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ODF3Q96PU9 254 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MGST2Q99735 147 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.31□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 H3BQ15 152 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 L7N2F9 121 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 CAMLGP49069 296 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 VAMP2P63027 116 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MORN5Q5VZ52 161 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZTI0 123 aa11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 C7orf66A4D0T2 115 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ENKURQ8TC29 256 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 NUDT15Q9NV35 164 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.29□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 BCAP31P51572 246 aa11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.28□□□□□ -0.6
ITGA3-211ENST00000508100 A0A096LPF7 62 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 C7orf71A4D174 169 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 EREGO14944 169 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00315P59091 139 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 MIC13Q5XKP0 118 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 MITD1Q8WV92 249 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 PFDN5Q99471 154 aa11.27□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 SIVA1O15304 175 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF253O75346 499 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 CAV2P51636 162 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 FUT9Q9Y231 359 aa11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 FAM25EA8MYX2 175 aa11.25□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 CST7O76096 145 aa11.25□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 PTTG1O95997 202 aa11.25□□□□□ -0.61
ITGA3-211ENST00000508100 C18orf15Q96N68 181 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms