RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 COX4I1P13073 169 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 PCOTHQ58A44 107 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 C1orf137Q5JT78 98 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 LRRC18Q8N456 261 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 MUCL1Q96DR8 90 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 AP1S3Q96PC3 154 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 CALML5Q9NZT1 146 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 RGS12O14924 1447 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 SOGA1O94964 1423 aa2.17□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 RTTNQ86VV8 2226 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 C5orf58C9J3I9 102 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 CD2P06729 351 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP12-1P59990 96 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 Q8TAT8 98 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 OR4C12Q96R67 309 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 U3KQ87 197 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.16□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.15□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.15□□□□□ -2.06
HERC3-209ENST00000504994 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ZNF727A8MUV8 499 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 C5orf67F2Z3F1 127 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 F8W036 122 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 HBDP02042 147 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 Q8N2B8 174 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 PSMF1Q92530 271 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TP53RKQ96S44 253 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 PFDN5Q99471 154 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 POLEQ07864 2286 aa2.15□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 COL24A1Q17RW2 1714 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 UQCRQO14949 82 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ERC2-IT1O76042 136 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 SLC25A4P12235 298 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 LCE3AQ5TA76 89 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CLEC2BQ92478 149 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 NABP2Q9BQ15 211 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 REG4Q9BYZ8 158 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 MYH1P12882 1939 aa2.14□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 BRWD1Q9NSI6 2320 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CCDC160A6NGH7 325 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 EVI2AP22794 236 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 BLCAPP62952 87 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 GLYATL3Q5SZD4 288 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 BANF2Q9H503 90 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TPT1P8Q9HAU6 139 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 BICRAQ9NZM4 1560 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 LAMB4A4D0S4 1761 aa2.13□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 C9orf170A2RU37 121 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 M0R2Z0 102 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 QRFPP83859 136 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TEX261Q6UWH6 196 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TSC22D3Q99576 134 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CCDC171Q6TFL3 1326 aa2.12□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 PTPRFP10586 1907 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TRACP01848 142 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 IGLC6P0CF74 106 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 LINC00694P0DN24 101 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CXCL8P10145 99 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CCL4P13236 92 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 AKR1D1P51857 326 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 C2orf82Q6UX34 121 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.11□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 SYNJ1O43426 1573 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 LAMB2P55268 1798 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 NOTCH2Q04721 2471 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 HYPMO75409 117 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-209ENST00000504994 CACNA1GO43497 2377 aa2.09□□□□□ -2.07
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