RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 PDE6HQ13956 83 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 KHDC3LQ587J8 217 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 SSX7Q7RTT5 188 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 BAP18Q8IXM2 172 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 STOML3Q8TAV4 291 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 NEU1Q99519 415 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRN-218ENST00000497977 COL7A1Q02388 2944 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 A0A1B0GV50 99 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 HBE1P02100 147 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CSN1S1P47710 185 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TCTAP57738 103 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SLC51BQ86UW2 128 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 BLNKQ8WV28 456 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 OR51M1Q9H341 326 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SLC17A3O00476 420 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SERF2P84101 59 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RRN3P1Q2M238 152 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RNF182Q8N6D2 247 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PAXXQ9BUH6 204 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 INSP01308 110 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SEC11BP0C7V7 166 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 IGLC2P0DOY2 106 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 HLA-DMBP28068 263 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FHITP49789 147 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF726P1Q15940 193 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RAB24Q969Q5 203 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00477Q96M19 166 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 C17orf77Q96MU5 243 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 F6UB75 175 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 H3BQ15 152 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 LEPP41159 167 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 CDKN1BP46527 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 DEFB1P60022 68 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RNF141Q8WVD5 230 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 C20orf173Q96LM9 149 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 LINC01587Q99440 93 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 A8MTW9 85 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FXYD7P58549 80 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PMS2P11Q13670 270 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 FXYD5Q96DB9 178 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF503Q96F45 646 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 X6R8D5 127 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TENM3Q9P273 2699 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 UMAD1C9J7I0 102 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 H7BYZ3 331 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRN-218ENST00000497977 NMBP08949 121 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms