RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	LILRA6	Q6PI73	481 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	OOSP1	A8MZH6	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01620	Q4KN68	170 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS46	E5RG02	174 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549		P0C879	139 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	IMUP	Q9GZP8	106 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A16	P16260	332 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXE3	Q13461	319 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CARD19	Q96LW7	228 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	UPK2	O00526	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00205	P59089	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZQT7	251 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N7P7	452 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASCL2	Q99929	193 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM23	O14925	209 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFC1B	P0CG36	223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFC1	P0CG37	223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N8P6	123 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	F5	P12259	2224 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFRSF4	P43489	277 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM258	P61165	79 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNHIT1	O43257	154 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCRG1	O75711	98 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELA2A	P08217	269 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIF	P15018	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01619	G3V211	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6D	Q14210	128 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	CR1L	Q2VPA4	569 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	UTF1	Q5T230	341 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUP37	Q8NFH4	326 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	HCFC1	P51610	2035 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		6.52	□□□□□ -1.36
CRNKL1-205	ENST00000496549	EPOP	A6NHQ4	379 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TFF2	Q03403	129 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BT86	120 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRLF1	O75462	422 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTBN2	O15020	2390 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LGALS9	O00182	355 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAL4	O96015	105 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX7C	P15954	63 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MLANA	Q16655	118 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASL10A	Q92737	203 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM186A	A6NE01	2351 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSPN	O60542	156 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00643	Q86TS7	51 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYNJ2BP	P57105	145 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CRNKL1-205	ENST00000496549	HCP5	Q6MZN7	132 aa		6.51	□□□□□ -1.37

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