RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 MST1LQ2TV78 715 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 K7EM74 188 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 MMP23AO75900 390 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 WT1-ASQ06250 92 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 ERCC8Q13216 396 aa13.63□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 DOCK7Q96N67 2140 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TTC32Q5I0X7 151 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 CSTL1Q9H114 145 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 SPRY4Q9C004 299 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TMEM238C9JI98 176 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 CKS1BP61024 79 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 RASL10AQ92737 203 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 DKK4Q9UBT3 224 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 H3BRN7 92 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZSR3 168 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 MTURNQ8N3F0 131 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 THAP8Q8NA92 274 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-53P01767 116 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 C22orf46C9J442 243 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 H3BUT2 72 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 LHBP01229 141 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 LINC00158P58513 81 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 LINC00479Q96M42 142 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 ADCYAP1P18509 176 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 AMN1Q8IY45 258 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 CTSZQ9UBR2 303 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PRSS46E5RG02 174 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TYMSP04818 313 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 IGLC1P0CG04 106 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PAX2Q02962 417 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 Q0VG73 95 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PCNX1Q96RV3 2341 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WWL8 130 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DEFB130BP0DP73 79 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DEFB130AP0DP74 79 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 XCL2Q9UBD3 114 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 A8MWV9 139 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 WIPF3A6NGB9 483 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C3orf79P0CE67 100 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 C1orf159Q96HA4 380 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 CDKN1BP46527 198 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 GTF3C1Q12789 2109 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TNFRSF6BO95407 300 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 APOC4P55056 127 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PRR25Q96S07 402 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 TSPAN13O95857 204 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 SS18Q15532 418 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 FAM120AOSQ5T036 256 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 NDUFS7O75251 213 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 RIPPLY3P57055 190 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 IL15RAQ13261 267 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF726P1Q15940 193 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 M0R2P5 195 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 ERG28Q9UKR5 140 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 LTBP2Q14767 1821 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-213ENST00000489895 GGTLC3B5MD39 225 aa13.53□□□□□ -0.24
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