RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 BLNKQ8WV28 456 aa6.62□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.62□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.62□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 A0A0J9YX75 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 A0A1W2PRE2 83 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 UBE2CO00762 179 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 CSN1S1P47710 185 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RNF182Q8N6D2 247 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 B9D2Q9BPU9 175 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 Q9H3A6 140 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 OTORQ9NRC9 128 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SORL1Q92673 2214 aa6.61□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RBAKDNA6NC62 111 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 A8MTW9 85 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 H3BMM0 161 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ATP6V1G1O75348 118 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 FHITP49789 147 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RANP62826 216 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 BLOC1S1P78537 153 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 PMS2P11Q13670 270 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ICAM4Q14773 271 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SSX7Q7RTT5 188 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 C20orf173Q96LM9 149 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 CITED4Q96RK1 184 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TENM2Q9NT68 2774 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 H3BTX0 84 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 IFNA7P01567 189 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 AMBPP02760 352 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TEX261Q6UWH6 196 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 Q6ZWC4 215 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 ODF3Q96PU9 254 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 CSTL1Q9H114 145 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 MANBALQ9NQG1 85 aa6.59□□□□□ -1.35
SORCS1-208ENST00000486192 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 PGPA6NDG6 321 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 KNCNA6PVL3 124 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 K7EQM0 130 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 IFNA1P01562 189 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF124Q15973 351 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 LINC00477Q96M19 166 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.58□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 FAM74A7A6NL05 159 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 GGTLC3B5MD39 225 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 DIRC3C9JPN6 131 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 F6UZH7 168 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 M0R3E3 92 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 NMBP08949 121 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 HLA-DMBP28068 263 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 TSPOP30536 169 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 HAGHQ16775 308 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.57□□□□□ -1.36
SORCS1-208ENST00000486192 SPATA25Q9BR10 227 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms