RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 UTF1Q5T230 341 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ENY2Q9NPA8 101 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 EPDR1Q9UM22 224 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.7□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 A0A096LNJ9 63 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 C15orf61A6NNL5 157 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DPM2O94777 84 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NPYP01303 97 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 IGKCP01834 107 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DEFA4P12838 97 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CCL4P13236 92 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 MYOD1P15172 320 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NMUP48645 174 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 INSL3P51460 131 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CACNG7P62955 275 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZR03 302 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NFE4Q86UQ8 179 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 RASL10AQ92737 203 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NGBQ9NPG2 151 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PRNDQ9UKY0 176 aa5.69□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ACACAQ13085 2346 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 C17orf98A8MV24 154 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 M0R2P5 195 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NCR2O95944 276 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 RBP4P02753 201 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 COL8A2P25067 703 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PLNP26678 52 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ID1P41134 155 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 UBE2D1P51668 147 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PMVKQ15126 192 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DEFB110Q30KQ9 67 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TMEM219Q86XT9 240 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PCP2Q8IVA1 136 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ORMDL3Q8N138 153 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CARD19Q96LW7 228 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 C18orf15Q96N68 181 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PAXXQ9BUH6 204 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 HCFC1P51610 2035 aa5.68□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 APC2O95996 2303 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 LINC01549A6NIU2 74 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 F8WDY8 70 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CCDC179H3BU77 68 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ACYP1P07311 99 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CSN3P07498 182 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 B4GALT1P15291 398 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ZNF32P17041 273 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FCER1GP30273 86 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FOXE3Q13461 319 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SPRY4Q9C004 299 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 DYSFO75923 2080 aa5.67□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 K7EMI3 77 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 UQCRQO14949 82 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CRLF1O75462 422 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ORM2P19652 201 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PRTN3P24158 256 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 CFHR2P36980 270 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 UCNP55089 124 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 ATP5J2P56134 94 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H4GQ99525 98 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TRGV9Q99603 122 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms