RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 LINC01546A6NGU7 62 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 F8W735 103 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 NPFFO15130 113 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 SIVA1O15304 175 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 BUB3O43684 328 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 PPP1R17O96001 155 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 HBDP02042 147 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 IGLC6P0CF74 106 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 RNF224P0DH78 156 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 CD33P20138 364 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 G0S2P27469 103 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 RHOGP84095 191 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 ATP5G2Q06055 141 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 KLRD1Q13241 179 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 C15orf32Q32M92 178 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 TDRG1Q3Y452 100 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 LCN12Q6JVE5 192 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 SGK494Q96LW2 274 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF747Q9BV97 191 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 SPTA1P02549 2419 aa6.52□□□□□ -1.36
PTPRD-209ENST00000477552 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 A0A0G2JLM5 398 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OR2T8A6NH00 312 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 PRSS47A8MTI9 375 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OVOL3O00110 214 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TCF21O43680 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGLL1P15814 213 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 GATA3P23771 443 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CKS2P33552 79 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 DSCR9P59020 149 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 LMO4P61968 165 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SEC11AP67812 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00477Q96M19 166 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 U3KQE9 123 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 H3BTX0 84 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OVOL1O14753 267 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CLEC3BP05452 202 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 MED14OSP0DP75 135 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SAA4P35542 130 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CRIP1P50238 77 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF138P52744 262 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 PAX8Q06710 450 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 C17orf77Q96MU5 243 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 KALRNO60229 2985 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ABCA4P78363 2273 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 D6R8Y8 96 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 M0R3E3 92 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 NDUFA4O00483 81 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ATP6V0E1O15342 81 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ATP5LO75964 103 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ORM1P02763 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGF1P05019 195 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 COX8AP10176 69 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 GPR183P32249 361 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 NDPQ00604 133 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TWIST1Q15672 202 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 BATFQ16520 125 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 PRORYQ9H606 182 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 RNF114Q9Y508 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 COX11Q9Y6N1 276 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ABCA1O95477 2261 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM89A2RUT3 159 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 A6NDN8 102 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 CD5LO43866 347 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV1-69P01742 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 HLA-DRB4P13762 266 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 DLX1P56177 255 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ECSCRQ19T08 205 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 MRAP2Q96G30 205 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-209ENST00000477552 C8orf49Q96NF6 230 aa6.49□□□□□ -1.37
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