RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf57Q99622 126 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP9Q99996 3911 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NF1P21359 2839 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM89A2RUT3 159 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 M0R3E3 92 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 BMPR1BO00238 502 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NUPR1O60356 82 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ND6P03923 174 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC3BP05452 202 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RAB9AP51151 201 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1D1P51857 326 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 BLCAPP62952 87 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q0VG73 95 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PSG3Q16557 428 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 S100A7AQ86SG5 101 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GPHB5Q86YW7 130 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NUP35Q8NFH5 326 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GLMPQ8WWB7 406 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NEU1Q99519 415 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RABAC1Q9UI14 185 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PSG8Q9UQ74 426 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GUS0 222 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 XKRY2A2RUG3 117 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RBAKDNA6NC62 111 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SOCS3O14543 225 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB2A1O75556 95 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV12-3P01733 135 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV4-59P01825 116 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB8P28062 276 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2G1P62253 170 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PSG9Q00887 426 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5G2Q06055 141 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 LY6EQ16553 131 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 WDR73Q6P4I2 378 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q6YL49 198 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N2B8 174 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RNF152Q8N8N0 203 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 USMG5Q96IX5 58 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SGK494Q96LW2 274 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 KLK15Q9H2R5 256 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ACANP16112 2415 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 HIGD1CA8MV81 97 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 A8MWL6 223 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SNURFLB1AK76 121 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PRAC2D3DTV9 90 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 F2Z2F3 143 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA4O00483 81 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CHEK1O14757 476 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DQA1P01909 254 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TRGV3P03979 118 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DMBP28068 263 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 TCL1AP56279 114 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 SLAQ13239 276 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 Q5PR19 223 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 OR5R1Q8NH85 324 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A10Q96PG2 267 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 PRR25Q96S07 402 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF702PQ9H963 129 aa4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms