RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10J6PQ8NGY7 276 aa12.2□□□□□ -0.46
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF503Q96F45 646 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAC2D3DTV9 90 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 SMLR1H3BR10 107 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 OR7C2O60412 319 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 JTBO76095 146 aa12.19□□□□□ -0.46
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RABGEF1-204ENST00000442563 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.19□□□□□ -0.46
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RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.19□□□□□ -0.46
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR10J4P0C629 311 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB2AP61019 212 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF345Q14585 488 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R3E3 92 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ICAM4Q14773 271 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ODF3Q96PU9 254 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 CYTL1Q9NRR1 136 aa12.17□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0D9SG52 128 aa12.16□□□□□ -0.46
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RABGEF1-204ENST00000442563 M0R2Z0 102 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB4AO15263 64 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPOP30536 169 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKN1BP46527 198 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00477Q96M19 166 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3BGRL3Q9H299 93 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM189A5PLL7 270 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 INSP01308 110 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 STAG3L2P0CL84 134 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 STAG3L3P0CL85 134 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 PHYHIPLQ96FC7 376 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 HBE1P02100 147 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 CT45A10P0DMU9 189 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 RANP62826 216 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB24Q969Q5 203 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 ARPC5LQ9BPX5 153 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 Q9H3A6 140 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf65A6NEN9 183 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 CSN1S1P47710 185 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 BAP18Q8IXM2 172 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TCTE3Q8IZS6 198 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa12.13□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 RXFP4Q8TDU9 374 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 NUPR2A6NF83 97 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 RRN3P1Q2M238 152 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 OTORQ9NRC9 128 aa12.12□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf1O96002 111 aa12.11□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 NMBP08949 121 aa12.11□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 PGPA6NDG6 321 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 GCHFRP30047 84 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R60P59551 318 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 ERCC8Q13216 396 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC01587Q99440 93 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM167BQ9NRX6 74 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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