RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF492Q9P255 531 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 HIGD1BQ9P298 99 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM213A2RRL7 107 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MYCNOSP40205 109 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 RIGQ13278 110 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WWL8 130 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A10P0DMU9 189 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q6AWC8 147 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 SFTA2Q6UW10 78 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRNTQ86SH4 94 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF714Q96N38 554 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRAP04437 139 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PRCDQ00LT1 54 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMD4Q96H15 378 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC3AQ02505 3323 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCA1O95477 2261 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 TEX29Q8N6K0 151 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB3Q92617 1050 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 SMKR1H3BMG3 65 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q86TA4 180 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.65□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q9H3A6 140 aa6.65□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 MDP1Q86V88 176 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF843Q8N446 348 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 ORMDL3Q8N138 153 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DL4Q99706 377 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 CD177Q8N6Q3 437 aa6.63□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.63□□□□□ -1.35
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RABGEF1-203ENST00000439720 NPYP01303 97 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-16P04430 117 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB2P49721 201 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 LOXL3P58215 753 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 RND1Q92730 232 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PAX8Q06710 450 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 PIFOQ8TCI5 191 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXC2Q99958 501 aa6.63□□□□□ -1.35
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