RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SHBGP04278 402 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 PRB1P04280 392 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CD2P06729 351 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CRHBPP24387 322 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CMPK1P30085 196 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 GNG11P61952 73 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 LCN6P62502 163 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6P435 159 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SSX8Q7RTT4 187 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF720Q7Z2F6 126 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM6Q96B49 74 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 STARD4Q96DR4 205 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SPIN2AQ99865 258 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.86□□□□□ -1.95
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CBX1P4-201ENST00000439415 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.86□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 BSNQ9UPA5 3926 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 J3KT08 172 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF286BP0CG31 522 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL3P10147 92 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 AQP4P55087 323 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RHEBQ15382 184 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE1FQ5T754 118 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6Q795 121 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A40Q8TBP6 338 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST6Q9GZX3 395 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 NAT8Q9UHE5 227 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA12Q86UK0 2595 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.85□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 FBN2P35556 2912 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.84□□□□□ -1.95
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CBX1P4-201ENST00000439415 E7EQ34 232 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5G3P48201 142 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R20P59543 309 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A10P60903 97 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 NCS1P62166 190 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS25P62851 125 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 PEA15Q15121 130 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 SVBPQ8N300 66 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF709Q8N972 641 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 THEM6Q8WUY1 208 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.84□□□□□ -1.95
CBX1P4-201ENST00000439415 ATMQ13315 3056 aa2.84□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 ITPR3Q14573 2671 aa2.84□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 THADAQ6YHU6 1953 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WXM4 84 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GW64 132 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf51A8MQB3 221 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 LY6HO94772 140 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 MT-ND4LP03901 98 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 DBIP07108 87 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 NMBP08949 121 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 GZMBP10144 247 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 EVI2AP22794 236 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BOP23527 126 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BBP33778 126 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 G6PCP35575 357 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 CSN1S1P47710 185 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BDP58876 126 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFA3P59666 94 aa2.83□□□□□ -1.96
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H2BCP62807 126 aa2.83□□□□□ -1.96
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