RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 GNGT1P63211 74 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 OR1P1Q8NH06 330 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 COQ8AQ8NI60 647 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 OR51M1Q9H341 326 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 RAB22AQ9UL26 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0G2JRQ6 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ERICH4A6NGS2 130 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 KRASP01116 189 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 OXTP01178 125 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HTN1P15515 57 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 CRYBB3P26998 211 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 G6PCP35575 357 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 RORCP51449 518 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ARPC4P59998 168 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 PSG9Q00887 426 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ESRGQ1W209 222 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 SPINK9Q5DT21 86 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HES5Q5TA89 166 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZN92 141 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 APH1BQ8WW43 257 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 PRNDQ9UKY0 176 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0B4J2A0 478 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 MFNGO00587 321 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 AGPAT2O15120 278 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 SIVA1O15304 175 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.922e-7■■■■■ 43.1
PTPRK-210ENST00000415055 PSCAO43653 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN13O95857 204 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 M6PRP20645 277 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 DTYMKP23919 212 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRK-210ENST00000415055 LPAR6P43657 344 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 WNT4P56705 351 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 SELENOTP62341 195 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 POU2AF1Q16633 256 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 FAM78BQ5VT40 261 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 HACD4Q5VWC8 232 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 CNIH2Q6PI25 160 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF709Q8N972 641 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM203Q969S6 136 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 UPK3BQ9BT76 320 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 MED4Q9NPJ6 270 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 COMMD9Q9P000 198 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-210ENST00000415055 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 F6UB75 175 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 INSP01308 110 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 UCHL1P09936 223 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 PTHLHP12272 177 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 OPRK1P41145 380 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 GNG2P59768 71 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 CDNFQ49AH0 187 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZS49 121 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 AHSA2Q719I0 299 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF546Q86UE3 836 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRK-210ENST00000415055 GTSF1Q8WW33 167 aa3.02□□□□□ -1.93
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