RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405755.6

PDE4D-207, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-207ENST00000405755 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 TEX29Q8N6K0 151 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 PSG8Q9UQ74 426 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF253O75346 499 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 FAM209BQ5JX69 171 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 CHEK1O14757 476 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 PHOX2AO14813 284 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 CBLN1P23435 193 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 HLA-DMBP28068 263 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 S100A12P80511 92 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-207ENST00000405755 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 A0A087X0K7 114 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RAB4BP61018 213 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RNF182Q8N6D2 247 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FOXC2Q99958 501 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF702PQ9H963 129 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 HIGD1CA8MV81 97 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SNURFLB1AK76 121 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CT45A10P0DMU9 189 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 LCN12Q6JVE5 192 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TSKUQ8WUA8 353 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NEU1Q99519 415 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ZNF492Q9P255 531 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RIPPLY3P57055 190 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 U3KQE9 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PDZD2O15018 2839 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 A0A1W2PS18 150 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 XKRY2A2RUG3 117 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TMEM89A2RUT3 159 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 A8MWL6 223 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 HAX1O00165 279 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 MEOX2P50222 304 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NUP35Q8NFH5 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 Q8TAT8 98 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 C16orf92Q96LL3 132 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 C8orf49Q96NF6 230 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 HOXA5P20719 270 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 S100A2P29034 98 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TM4SF20Q53R12 229 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 WDR73Q6P4I2 378 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TCF24Q7RTU0 167 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GLMPQ8WWB7 406 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 VGLL1Q99990 258 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 ELANEP08246 267 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 FOXE3Q13461 319 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CT83Q5H943 113 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CFAP161Q6P656 301 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 CD5LO43866 347 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 MT-ND6P03923 174 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PRR25Q96S07 402 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-207ENST00000405755 PRAC2D3DTV9 90 aa7.23□□□□□ -1.25
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