RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 A0A087WX48 190 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE12JA6NER3 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 C15orf61A6NNL5 157 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE7O76087 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE12FP0CL80 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE12GP0CL81 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE12IP0CL82 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE4Q13068 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 NUP35Q8NFH5 326 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 C9JCJ5 164 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 GCHFRP30047 84 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 Q6AWC8 147 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 CACNA1BQ00975 2339 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 CXorf1O96002 111 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 FOXI1Q12951 378 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TEX29Q8N6K0 151 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 OSTCQ9NRP0 149 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 PRNDQ9UKY0 176 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TEPPQ6URK8 271 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 Q8N7P7 452 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 RAX2Q96IS3 184 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFS7O75251 213 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01545Q5VT33 79 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00479Q96M42 142 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 UPK2O00526 184 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ACTL6BO94805 426 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 KLRD1Q13241 179 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 NFE4Q86UQ8 179 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 CCL19Q99731 98 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV1-16P04430 117 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 CSN1S1P47710 185 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 PTH2Q96A98 100 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV4-39P01824 125 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXA3-201ENST00000317201 LRBAP50851 2863 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 LY6LH3BQJ8 138 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 A8MWL6 223 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OR5AL1P0C617 328 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TCF19Q9Y242 345 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 HIGD1CA8MV81 97 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 RNF5Q99942 180 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01548A6NM66 108 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 FXYD7P58549 80 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ODF3BA8MYP8 253 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV2-8P01709 118 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 CT45A10P0DMU9 189 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 LMO4P61968 165 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 SFTA2Q6UW10 78 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 PRO0461Q9UI25 63 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 C15orf62A8K5M9 175 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 IGLL5B9A064 214 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 LTAP01374 205 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 PRCDQ00LT1 54 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV2-23P01705 113 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 COX6B1P14854 86 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 C11orf52Q96A22 123 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 AJUBAQ96IF1 538 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXA3-201ENST00000317201 HCP5Q6MZN7 132 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms