RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PRF3 423 aa21.86■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PRM7 423 aa21.86■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 FAM104BQ5XKR9 115 aa21.86■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 RABAC1Q9UI14 185 aa21.86■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 RPS20P60866 119 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 PRR25Q96S07 402 aa21.85■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 ATRXP46100 2492 aa21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 PTTG1IPP53801 180 aa21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 RELQ04864 619 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 UBE2V1Q13404 147 aa21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 DYNAPQ8N1N2 210 aa21.84■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 OR2T8A6NH00 312 aa21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 CTSGP08311 255 aa21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 MPV17L2Q567V2 206 aa21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 ORMDL3Q8N138 153 aa21.83■■□□□ 1.09
UBP1-201ENST00000283628 D6R8Y8 96 aa21.83■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 H0Y8G0 127 aa21.83■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 C12orf54Q6X4T0 127 aa21.83■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa21.82■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TMEM11P17152 192 aa21.82■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 BMI1P35226 326 aa21.82■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 PRELID3AQ96N28 172 aa21.82■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TMEM213A2RRL7 107 aa21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 CCL25O15444 150 aa21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TP73-AS1Q9UF72 201 aa21.81■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 TACC2O95359 2948 aa21.8■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-23P01764 117 aa21.8■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 PMCHL2Q9BQD1 86 aa21.8■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 AMN1Q8IY45 258 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 NUDT3O95989 172 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZVH6 145 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 NCOR2Q9Y618 2525 aa21.79■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 DPF1Q92782 380 aa21.78■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 A0A096LNJ9 63 aa21.78■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa21.78■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 COX8AP10176 69 aa21.77■■□□□ 1.08
UBP1-201ENST00000283628 DTX2Q86UW9 622 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 IGHG4P01861 327 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 IGLC6P0CF74 106 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 FAM106CPP0CH98 169 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 RAB9AP51151 201 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 Q8N9W7 124 aa21.76■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 LRBAP50851 2863 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 KLK9Q2XQG4 91 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 FAM106AQ4KMX7 169 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 VGLL1Q99990 258 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 SIRPDQ9H106 197 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 KLK9Q9UKQ9 250 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 ABCA4P78363 2273 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 DEFB125Q8N687 156 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 CBY1Q9Y3M2 126 aa21.75■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 DCHS2Q6V1P9 2916 aa21.74■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 NCR2O95944 276 aa21.74■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 Q8TAT8 98 aa21.74■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 A0A087X0K7 114 aa21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 LGALS9BQ3B8N2 356 aa21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 LGALS9CQ6DKI2 356 aa21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 TWIST1Q15672 202 aa21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 ZNF502Q8TBZ5 544 aa21.73■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 HBDP02042 147 aa21.72■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 OR8A1Q8NGG7 326 aa21.72■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 TAX1BP3O14907 124 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 CKS2P33552 79 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 PAX8Q06710 450 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 CNFNQ9BYD5 112 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 GPR183P32249 361 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa21.71■■□□□ 1.07
UBP1-201ENST00000283628 C15orf32Q32M92 178 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 OR1N2Q8NGR9 330 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 MUC21A0A140T8X8 626 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 RBAKDNA6NC62 111 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 FABP5P3A8MUU1 101 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 MUC21Q5SSG8 566 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 ZFAND3Q9H8U3 227 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 COL6A6A6NMZ7 2263 aa21.7■■□□□ 1.06
UBP1-201ENST00000283628 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms