RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261834.9

ATG2B-201, Transcript of autophagy related 2B, humanhuman

TSL 2

Gene ATG2B, Length 1,920 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2B-201ENST00000261834 PRTN3P24158 256 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 MC5RP33032 325 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 DLX1P56177 255 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 DSCR9P59020 149 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 LMO4P61968 165 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 RIGQ13278 110 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 RPEQ96AT9 228 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HARBI1Q96MB7 349 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SPG11Q96JI7 2443 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 UPK2O00526 184 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 LINC01559Q495D7 138 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TMEM177Q53S58 311 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 NRGNQ92686 78 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 FXYD5Q96DB9 178 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 LINC00479Q96M42 142 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 CENPEQ02224 2701 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 COL8A1P27658 744 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OR4A5Q8NH83 315 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 GTSF1Q8WW33 167 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 FBN2P35556 2912 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 A0A1B0GUT8 65 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 H0Y8G0 127 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 MRAP2Q96G30 205 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 VGLL1Q99990 258 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HINT2Q9BX68 163 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ODF3BA8MYP8 253 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 MOSP00540 346 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HLA-DRB4P13762 266 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 KLRD1Q13241 179 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 MOB3BQ86TA1 216 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 THAP8Q8NA92 274 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SIRPDQ9H106 197 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 DPM3Q9P2X0 92 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PYYP10082 97 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SLC25A16P16260 332 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 CKS1BP61024 79 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 THYN1Q9P016 225 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PGPA6NDG6 321 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 LY6LH3BQJ8 138 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 RAB9AP51151 201 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HCP5Q6MZN7 132 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 PTPN13Q12923 2485 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 A0A1W2PPI3 338 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 OOSP1A8MZH6 123 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 HBDP02042 147 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TCRAP04437 139 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 UBE2E1P51965 193 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 TAL2Q16559 108 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG2B-201ENST00000261834 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms