RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 FAM223BA6NKX1 122 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 GATA3P23771 443 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 BAGE3Q86Y29 109 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 CHEK1O14757 476 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 TRBV12-3P01733 135 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 OR5R1Q8NH85 324 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 APCP25054 2843 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF253O75346 499 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 CSN1S1P47710 185 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 KLK15Q9H2R5 256 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 VGLL1Q99990 258 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 FAM231BA6NCW3 169 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 CD33P20138 364 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 TPPP2P59282 170 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 TENM4Q6N022 2769 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 A0A087X0K7 114 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 U3KQE9 123 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 CR1P17927 2039 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 HBBP68871 147 aa13.08□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
FCHO1-201ENST00000252771 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 TGFAP01135 160 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 LCN12Q6JVE5 192 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 RNF182Q8N6D2 247 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ATP6V0BQ99437 205 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 RNF223E7ERA6 249 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 M0QZK8 103 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 RAB9AP51151 201 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 Q6ZWC4 215 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 Q8TAT8 98 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.08□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 A8MWP6 167 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 PRAC2D3DTV9 90 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 S100A7P31151 101 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 IQCJQ1A5X6 159 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 PRR25Q96S07 402 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 BRI3O95415 125 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV4-59P01825 116 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ARL3P36405 182 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 METTL26Q96S19 204 aa13.07□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 PAFAH1B2P68402 229 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 A0A1W2PS18 150 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 IGLV1-40P01703 118 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV3-11P01762 117 aa13.06□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 CFHR3Q02985 330 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 TMEM95Q3KNT9 176 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 RNF114Q9Y508 228 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 GPX1P07203 203 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ERCC8Q13216 396 aa13.05□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 CHD6Q8TD26 2715 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 H3BUA1 57 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF575Q86XF7 245 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 HAX1O00165 279 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SH2D1AO60880 128 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 KCNS1Q96KK3 526 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 CT45A10P0DMU9 189 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 PF4V1P10720 104 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 USMG5Q96IX5 58 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 PRO1933Q9H354 126 aa13.04□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 J3QLI3 93 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.03□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.02□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.02□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.02□□□□□ -0.32
FCHO1-201ENST00000252771 GLMPQ8WWB7 406 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-201ENST00000252771 SCGB1D1O95968 90 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-201ENST00000252771 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.02□□□□□ -0.33
FCHO1-201ENST00000252771 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.01□□□□□ -0.33
FCHO1-201ENST00000252771 A0A1B0GUT8 65 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms