RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 F8W1H4 67 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 SIVA1O15304 175 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 CADP27708 2225 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 K7EN84 100 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 CSTL1Q9H114 145 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 Q8N8P6 123 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 CREBBPQ92793 2442 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 GHRHP01286 108 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 FAM168AQ92567 244 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA13-201ENST00000222753 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 C2orf82Q6UX34 121 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 Q6ZR03 302 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 Q8TCH9 128 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 PEMTQ9UBM1 199 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 CDKN1BP46527 198 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 NDUFB8O95169 186 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 THAP8Q8NA92 274 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 MED13LQ71F56 2210 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1W2PPM0 123 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 TAL2Q16559 108 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 LINC00311Q8N616 119 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 FXYD5Q96DB9 178 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 EP400Q96L91 3159 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 CACNA1BQ00975 2339 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF876PQ49A33 203 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 DPH3Q96FX2 82 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 NOTCH4Q99466 2003 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 RNF138Q8WVD3 245 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 WT1-ASQ06250 92 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 DEFB125Q8N687 156 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 ETDBQ3ZM63 59 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 C9JAW5 83 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 PRR25Q96S07 402 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXA13-201ENST00000222753 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 KLRD1Q13241 179 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF134P52741 427 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 MAJINQ3KP22 176 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 C8orf49Q96NF6 230 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 K7EM74 188 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 CFAP161Q6P656 301 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF747Q9BV97 191 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 H3BRN7 92 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 LTAP01374 205 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 USMG5Q96IX5 58 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 FAM223BA6NKX1 122 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 NUPR1O60356 82 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 ERCC8Q13216 396 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 RASL10AQ92737 203 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM141Q96I45 108 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 LY6DQ14210 128 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 CCL25O15444 150 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM86BQ8N661 226 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 IGLV1-44P01699 117 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 NDPQ00604 133 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 CEND1Q8N111 149 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 NPYP01303 97 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXA13-201ENST00000222753 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms