RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637121.1

EFHC1-228, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 3

Gene EFHC1, Length 2,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-228	ENST00000637121	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A0A0U1RRA0	63 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CNIH1	O95406	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		Q8N976	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A0A1B0GUT8	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		F2Z2F3	143 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CCL25	O15444	150 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NTF3	P20783	257 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MAL	P21145	153 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PRTN3	P24158	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CSN1S1	P47710	185 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	GNG5	P63218	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PSG9	Q00887	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM168A	Q92567	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NRGN	Q92686	78 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PLAU	P00749	431 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	EDN2	P20800	178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PTH2	Q96A98	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		K7EIM0	57 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	GNG7	O60262	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	RITA1	Q96K30	269 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		A6NNC1	897 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TIMM23	O14925	209 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	NDUFB8	O95169	186 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHG4	P01861	327 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	COX7A1	P24310	79 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	EBI3	Q14213	229 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121		Q6ZN92	141 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.15	□□□□□ -1.74
EFHC1-228	ENST00000637121	ACACA	Q13085	2346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	CNTFR	P26992	372 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EFHC1-228	ENST00000637121	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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