RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 CNTFRP26992 372 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 CKS1BP61024 79 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 ERCC8Q13216 396 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHV2-5P01817 119 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 PF4P02776 101 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 ERVK11-1P61568 191 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF876PQ49A33 203 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZWC4 215 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 MDS2Q8NDY4 140 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM101Q96IK0 257 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZVH6 145 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDR86Q86TI4 376 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 VOPP1Q96AW1 172 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.09□□□□□ -1.11
RAPGEF6-215ENST00000627212 FCN3O75636 299 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 COL8A2P25067 703 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZS49 121 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRGV9Q99603 122 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 GGTLC3B5MD39 225 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLAQ13239 276 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 LAGE3Q14657 143 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZR03 302 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PROK2Q9HC23 129 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TDGF1P13385 188 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 MGAMO43451 1857 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A087WWL8 130 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 A8MWV9 139 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 F2Z2F3 143 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 H3BRM9 83 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 NUP37Q8NFH4 326 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 DPH3Q96FX2 82 aa8.08□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0G2JNJ9 132 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 MMP23AO75900 390 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 RNF182Q8N6D2 247 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q9UFV3 132 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PAX1P15863 534 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TEX29Q8N6K0 151 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 CFPP27918 469 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSG3Q16557 428 aa8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGHV3-53P01767 116 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLNP26678 52 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 H3BUX3 64 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q86TA4 180 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF134P52741 427 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 MAJINQ3KP22 176 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 COPS9Q8WXC6 57 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 ERG28Q9UKR5 140 aa8.06□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLL1P15814 213 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 VWC2Q2TAL6 325 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 COX11Q9Y6N1 276 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLC2P0DOY2 106 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLC3P0DOY3 106 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 IL15RAQ13261 267 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNFRSF14Q92956 283 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 RCHY1Q96PM5 261 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TOMM40O96008 361 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 C8orf49Q96NF6 230 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 CSTL1Q9H114 145 aa8.05□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM231BA6NCW3 169 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q0VG73 95 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDR81Q562E7 1941 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 KNCNA6PVL3 124 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 WT1-ASQ06250 92 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 STHQ8IWL8 128 aa8.04□□□□□ -1.12
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.2 ms