RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 H3BNG1 76 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 H3BP45 60 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 OR5G3P0C626 314 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 LINC00869P0C866 280 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 TNFSF8P32971 234 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 SOSTQ9BQB4 213 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 UPK3BQ9BT76 320 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-210ENST00000580799 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SMCO3A2RU48 225 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 K7EPK0 472 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SFT2D2O95562 160 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 HOXB5P09067 269 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 CXCL2P19875 107 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TMBIM6P55061 237 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 OR5I1Q13606 314 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 LCN15Q6UWW0 184 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 UHRF2Q96PU4 802 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 FNDC10F2Z333 226 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 RLN2P04090 185 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 DLK1P80370 383 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ID3Q02535 119 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PPP1R1AQ13522 171 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TRIM63Q969Q1 353 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ARL6Q9H0F7 186 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SNURFLB1AK76 121 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 C4orf46Q504U0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TEPPQ6URK8 271 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 CCDC190Q86UF4 302 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 MCFD2Q8NI22 146 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SMIM8Q96KF7 97 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ARV1Q9H2C2 271 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PSENENQ9NZ42 101 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GOSR2O14653 212 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 HOXA5P20719 270 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 KRTAP10-2P60368 255 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ESRGQ1W209 222 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PYDC2Q56P42 97 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PATE2Q6UY27 113 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ZNF546Q86UE3 836 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 A0A0J9YY99 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GAGE12BA1L429 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SSSCA1O60232 199 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GAGE7O76087 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GAGE12FP0CL80 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GAGE12GP0CL81 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GAGE12IP0CL82 117 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ODF3Q96PU9 254 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 C9orf170A2RU37 121 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 H3BMQ9 156 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TSC22D2O75157 780 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 LEPP41159 167 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TAS2R30P59541 319 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 KIR3DS1Q14943 382 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 C18orf15Q96N68 181 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 GGACTQ9BVM4 153 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 V9GYH0 126 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-210ENST00000580799 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-210ENST00000580799 EPM2AB3EWF7 344 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-210ENST00000580799 EREGO14944 169 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-210ENST00000580799 AGPAT2O15120 278 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-210ENST00000580799 COX7A2P2O60397 106 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-210ENST00000580799 CCNKO75909 580 aa7.08□□□□□ -1.28
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