RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 COQ8AQ8NI60 647 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FRZBQ92765 325 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 Q9H8V8 135 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 LYRM9A8MSI8 78 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 BUB3O43684 328 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IGLC1P0CG04 106 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB130BP0DP73 79 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB130AP0DP74 79 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SCGB1A1P11684 91 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 OR10J1P30954 320 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 RORCP51449 518 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PTTG1IPP53801 180 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R20P59543 309 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 DLK1P80370 383 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 MXD1Q05195 221 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SSX7Q7RTT5 188 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SSR3Q9UNL2 185 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ATG12O94817 140 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A4P12235 298 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA3P12429 323 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PMCHP20382 165 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SDC2P34741 201 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PSMB3P49720 205 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 RND2P52198 227 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1C2P52895 323 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 AQP4P55087 323 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF79Q15937 498 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FAM78BQ5VT40 261 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 NPIPB3Q92617 1050 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 C18orf15Q96N68 181 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 KLK11Q9UBX7 282 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 F6UB75 175 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TOMM40O96008 361 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1-5P01602 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5G1P05496 136 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PSMB9P28065 219 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 HRH1P35367 487 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ATP5G3P48201 142 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PAX9P55771 341 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 XGP55808 180 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ASAH1Q13510 395 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PTH2Q96A98 100 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM12Q96EX1 92 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 Q9H3A6 140 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087X0K7 114 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0J9YX75 114 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FAM25AB3EWG3 89 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FAM25CB3EWG5 89 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FAM25GB3EWG6 89 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TSTD3H0UI37 97 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TNFAIP8O95379 198 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PRM2P04554 102 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 P0C879 139 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 FCN2Q15485 313 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-210ENST00000578916 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 DISC1C4P0D8 188 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PSG1P11464 419 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PGAM2P15259 253 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS3P35030 304 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1D1P51857 326 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 GPR146Q96CH1 333 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ACY3Q96HD9 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 UHRF2Q96PU4 802 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RPRMQ9NS64 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 DOK5Q9P104 306 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RAB26Q9ULW5 256 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ISLRO14498 428 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SOCS3O14543 225 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 INSP01308 110 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TSPOP30536 169 aa6.32□□□□□ -1.4
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