RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		14.49	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	GATD1	Q8NB37	220 aa		14.49	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A10	P0DMU9	189 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TSPO	P30536	169 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	UCN	P55089	124 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LRBA	P50851	2863 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF785	A8K8V0	405 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FOSL1	P15407	271 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CSN1S1	P47710	185 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PSG9	Q00887	426 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		14.48	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LY6H	O94772	140 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	KLRD1	Q13241	179 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CD24	P25063	80 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	S100A7	P31151	101 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	KLRB1	Q12918	225 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MAJIN	Q3KP22	176 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		14.47	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559		M0QZ24	198 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	OVOL3	O00110	214 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGLL1	P15814	213 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		14.46	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	OR4C46	A6NHA9	309 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ST20	Q9HBF5	79 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	EBI3	Q14213	229 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	PRR31	Q5SQ13	230 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		14.45	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	PET117	Q6UWS5	81 aa		14.44	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N6K4	173 aa		14.44	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		M0R3E3	92 aa		14.44	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	CRIP1	P50238	77 aa		14.44	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		14.43	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		S4R3C0	116 aa		14.43	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		14.43	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		14.43	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRD5	423 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRF3	423 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRM7	423 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		F8W735	103 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	STPG4	Q8N801	248 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TFPI2	P48307	235 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		14.42	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	NDP	Q00604	133 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	CDSN	Q15517	529 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM189	A5PLL7	270 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM11	P17152	192 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DTX2	Q86UW9	622 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RABAC1	Q9UI14	185 aa		14.41	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB8	O95169	186 aa		14.4	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	FBLN7	Q53RD9	439 aa		14.4	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		14.4	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf49	Q96NF6	230 aa		14.4	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TPPP3	Q9BW30	176 aa		14.4	□□□□□ -0.1
RRN3-205	ENST00000563559	FA2H	Q7L5A8	372 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T8	A6NH00	312 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CSN3	P07498	182 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CTSG	P08311	255 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NPS	P0C0P6	89 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM106CP	P0CH98	169 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF138	P52744	262 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NBAS	A2RRP1	2371 aa		14.39	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ASCL2	Q99929	193 aa		14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D1A	O60880	128 aa		14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		14.38	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		14.37	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	BMI1	P35226	326 aa		14.37	□□□□□ -0.11
RRN3-205	ENST00000563559	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms