RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HRH1	P35367	487 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MEOX2	P50222	304 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TEPP	Q6URK8	271 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A075B6Q4	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPAN5	P62079	268 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CATR1	Q13166	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC190	Q86UF4	302 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35G3	Q8N808	338 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CORT	O00230	105 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB2A1	O75556	95 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFAIP8	O95379	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SNCA	P37840	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	VWC2	Q2TAL6	325 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GFI1	Q99684	422 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MGLL	Q99685	303 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MSMO1	Q15800	293 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HACD4	Q5VWC8	232 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	UFD1	Q92890	307 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617		Q9UF83	564 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	PRAC2	D3DTV9	90 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV1-39	P01597	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV1D-39	P04432	117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CXCL3	P19876	107 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	CCR6	P51684	374 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LYZ	P61626	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	COX6A2	Q02221	97 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF90	Q03938	601 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAM1	Q15629	374 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	BSX	Q3C1V8	233 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	NIT1	Q86X76	327 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	PHYHIP	Q92561	330 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB3C	Q96E17	227 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	C2orf50	Q96LR7	162 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00477	Q96M19	166 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A22	Q9H936	323 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WXM4	84 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	RLN1	P04808	185 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	F2R	P25116	425 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	PSMB9	P28065	219 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	TCRB	P04435	133 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	UCHL1	P09936	223 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	GALR1	P47211	349 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4A16	Q8NH70	328 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	ACY3	Q96HD9	319 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC22A	Q96IW7	307 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	ARL6IP5	O75915	188 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD4	P59646	89 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	FABP5	Q01469	135 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB11B	Q15907	218 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.5	□□□□□ -1.37

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