RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.08□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 ANXA3P12429 323 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 CDKN1BP46527 198 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.08□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.08□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.07□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 MED6O75586 246 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 CCNKO75909 580 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 LINC00869P0C866 280 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 VAMP1P23763 118 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 Q6ZTI0 123 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 SNURFLB1AK76 121 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 ADAP1O75689 374 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 PATE2Q6UY27 113 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 FRZBQ92765 325 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 ZNF503Q96F45 646 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 ARL6Q9H0F7 186 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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CS-227ENST00000551441 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 CTDSPLO15194 276 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 S100A7P31151 101 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-227ENST00000551441 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 SIVA1O15304 175 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 ERVFC1-1P60608 527 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.01□□□□□ -0.65
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CS-227ENST00000551441 EREGO14944 169 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 NXPH4O95158 308 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 SMIM18P0DKX4 95 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
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CS-227ENST00000551441 ARV1Q9H2C2 271 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11□□□□□ -0.65
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CS-227ENST00000551441 PPP1R1AQ13522 171 aa11□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 TMEM128Q5BJH2 165 aa11□□□□□ -0.65
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CS-227ENST00000551441 H3BNG1 76 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 IFNA5P01569 189 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 SLC25A6P12236 298 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 PLP1P60201 277 aa10.99□□□□□ -0.65
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CS-227ENST00000551441 LRTM2Q8N967 370 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 SSSCA1O60232 199 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 SFT2D2O95562 160 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 LCN15Q6UWW0 184 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-227ENST00000551441 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.98□□□□□ -0.65
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