RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 DTD1Q8TEA8 209 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 MITD1Q8WV92 249 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 RPRMQ9NS64 109 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 DKK2Q9UBU2 259 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.03□□□□□ -1.44
TROAP-208ENST00000548817 C9orf170A2RU37 121 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TEX46H3BTG2 121 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 J3QL48 77 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ISLRO14498 428 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 MPC2O95563 127 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RLN2P04090 185 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 CXCL2P19875 107 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GALR1P47211 349 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 MEOX2P50222 304 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RAB11AP62491 216 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SMCO1Q147U7 214 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 FAM78BQ5VT40 261 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 OR1S1Q8NH92 325 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 IL22RA2Q969J5 263 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C16orf92Q96LL3 132 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 NMES1Q9C002 83 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RBKSQ9H477 322 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.02□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C5orf51A6NDU8 294 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TAAR5O14804 337 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 BCL2L11O43521 198 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 AKR1C4P17516 323 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 VAMP1P23763 118 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 H2BFSP57053 126 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 DEFB1P60022 68 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SRPXP78539 464 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GAMTQ14353 236 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TOR2AQ5JU69 321 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 UQCC3Q6UW78 93 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 FRZBQ92765 325 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 DOK5Q9P104 306 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GPR132Q9UNW8 380 aa6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 A0A0J9YX75 114 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 FAM25EA8MYX2 175 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 G3V3Q6 166 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SIX6O95475 246 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SFT2D2O95562 160 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 PAX9P55771 341 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 B2MP61769 119 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ZNF90Q03938 601 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 Q5VSD8 79 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SYT8Q8NBV8 401 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RSG1Q9BU20 258 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A22Q9H936 323 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 HSPB7Q9UBY9 170 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 NACAE9PAV3 2078 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 RAB19A4D1S5 217 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 LYRM9A8MSI8 78 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 F6UB75 175 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 MED6O75586 246 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 INSP01308 110 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C6orf223Q8N319 242 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ZNF709Q8N972 641 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 C2orf50Q96LR7 162 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 GPR82Q96P67 336 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 TRGV9Q99603 122 aa5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 F5H768 121 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 SOCS3O14543 225 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 NUDT3O95989 172 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 NMBP08949 121 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 DEFB130BP0DP73 79 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 DEFB130AP0DP74 79 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 ORM2P19652 201 aa5.98□□□□□ -1.45
TROAP-208ENST00000548817 CCL18P55774 89 aa5.98□□□□□ -1.45
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