RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 STOML3Q8TAV4 291 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00479Q96M42 142 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 AQP10Q96PS8 301 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.09□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 J3QKU1 62 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 M0R1W7 72 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 ODF3BA8MYP8 253 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SLC51BQ86UW2 128 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 MMP26Q9NRE1 261 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 PAX6P26367 422 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 REG3AQ06141 175 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGSF23A1L1A6 192 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 BCL2L11O43521 198 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SYNGR2O43760 224 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ATG12O94817 140 aa3.06□□□□□ -1.92
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