RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504458.1

SERF1A-204, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, human

TSL 4 BASIC

Gene SERF1A, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1A-204	ENST00000504458	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		M0R1W7	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TCAP	O15273	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		P01737	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LIPF	P07098	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ORM2	P19652	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	S100A7	P31151	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CEACAM3	P40198	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CTRL	P40313	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TCL1A	P56279	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HBB	P68871	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	GAGE1	Q13065	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		Q6AWC8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NIT1	Q86X76	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		Q8N976	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NPB	Q8NG41	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RPE	Q96AT9	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		Q9H3A6	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ABCA4	P78363	2273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	APC	P25054	2843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		F2Z2F3	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		I3L2K1	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		K7EQM0	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HSBP1	O75506	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NDUFA3	O95167	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MOS	P00540	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CDKN1A	P38936	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	KRTDAP	P60985	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SLA	Q13239	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PDE6H	Q13956	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RITA1	Q96K30	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NF1	P21359	2839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		H3BRN7	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SPINK4	O60575	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	PSG1	P11464	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	HTR1D	P28221	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	SLC35B1	P78383	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458		Q86TA4	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	MUC15	Q8N387	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SERF1A-204	ENST00000504458	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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