RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	PGP	A6NDG6	321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	IGF1	P05019	195 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	CITED1	Q99966	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	CD28	P10747	220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A7	P31151	101 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	ADM	P35318	185 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508		Q9H3A6	140 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	BRI3	O95415	125 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	GCG	P01275	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BUA1	57 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR183	P32249	361 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508		H3BTX0	84 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	AP4M1	O00189	453 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	CLEC3B	P05452	202 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	GNG5	P63218	68 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	BMPR1B	O00238	502 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TYMS	P04818	313 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5I1	Q13606	314 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ISLR	O14498	428 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TCRA	P04437	139 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A6	P06703	90 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2G1	P62253	170 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGV3	P03979	118 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGC2	P03986	189 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	PDE6H	Q13956	83 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508		V9GYV3	84 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PRX2	142 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	C5orf52	A6NGY3	159 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	GNB4	Q9HAV0	340 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB9A	P51151	201 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.22	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms